宏基因组第二代测序技术诊断鹦鹉热衣原体肺炎1例

诊断学理论与实践››2022,Vol. 21››Issue (05): 635-637.doi:10.16150/j.1671-2870.2022.05.016

宏基因组第二代测序技术诊断鹦鹉热衣原体肺炎1例

张祥钦, 江勇()

广州医科大学附属深圳沙井医院呼吸与危重症医学科，广东深圳 518000

收稿日期:2021-02-05出版日期:2022-10-25发布日期:2023-01-29
通讯作者:江勇 E-mail:jiangyongszzxy@163.com
基金资助:
广东省中医药局课题项目资助课题(20211344)

Chlamydia psittacipneumonia diagnosed by metagenomics next-generation sequencing: a case report

ZHANG Xiangqin, JIANG Yong()

Department of Respiratory and Critical Care Medicine, Shenzhen Shajing Hospital Affiliated to Guangzhou Medical University, Guangdong Shenzhen 518000, China

Received:2021-02-05Online:2022-10-25Published:2023-01-29
Contact:JIANG Yong E-mail:jiangyongszzxy@163.com

摘要/Abstract

摘要：

鹦鹉热衣原体肺炎是一类临床较为少见的人畜共患疾病。由于该病缺乏特异性的临床症状表现及有效、快捷的实验室诊断方法，且部分病例往往没有明确的流行病学资料，因此增加了临床确诊的难度。本文报道1例通过宏基因组第二代测序（metagenomic next-generation sequencing，mNGS）技术诊断的鹦鹉热衣原体肺炎病例，提示mNGS这项技术在不明病原体的社区获得性肺炎诊断具有较高的临床应用价值。

中图分类号:

R518.1

张祥钦, 江勇. 宏基因组第二代测序技术诊断鹦鹉热衣原体肺炎1例[J]. 诊断学理论与实践, 2022, 21(05): 635-637.

ZHANG Xiangqin, JIANG Yong.Chlamydia psittacipneumonia diagnosed by metagenomics next-generation sequencing: a case report[J]. Journal of Diagnostics Concepts & Practice, 2022, 21(05): 635-637.

图/表2

参考文献9

[1]	Kozuki E, Arima Y, Matsui T, et al. Human psittacosis in Japan: notification trends and differences in infection source and age distribution by gender, 2007 to 2016[J]. Ann Epidemiol, 2020, 44:60-63. doi:S1047-2797(20)30131-9pmid:32253059
[2]	Balsamo G, Maxted AM, Midla JW, et al. Compendium of measures to control chlamydia psittaci infection among humans (Psittacosis) and pet birds (Avian Chlamydiosis), 2017[J]. J Avian Med Surg, 2017, 31(3):262-282. doi:10.1647/217-265pmid:28891690
[3]	Hogerwerf L, de Gier B, Baan B, et al. Chlamydia psittaci (psittacosis) as a cause of community-acquired pneumonia: a systematic review and meta-analysis[J]. Epidemiol Infect, 2017, 145(15):3096-3105. doi:10.1017/S0950268817002060pmid:28946931
[4]	de Gier B, Hogerwerf L, Dijkstra F, et al. Disease burden of psittacosis in the Netherlands[J]. Epidemiol Infect, 2018, 146(3):303-305. doi:10.1017/S0950268817003065pmid:29361998
[5]	Fraeyman A, Boel A, van Vaerenbergh K, et al. Atypical pneumonia due to Chlamydophila psittaci: 3 case reports and review of literature[J]. Acta Clin Belg, 2010, 65(3):192-196. doi:10.1179/acb.2010.040pmid:20669788
[6]	Cheng YJ, Lin KY, Chen CC, et al. Zoonotic atypical pneumonia due to Chlamydophila psittaci: first reported psittacosis case in Taiwan[J]. J Formos Med Assoc, 2013, 112(7):430-433. doi:10.1016/j.jfma.2012.08.017 URL
[7]	中华医学会检验医学分会临床微生物学组, 中华医学会微生物学与免疫学分会临床微生物学组, 中国医疗保健国际交流促进会临床微生物与感染分会. 宏基因组高通量测序技术应用于感染性疾病病原检测中国专家共识[J]. 中华检验医学杂志, 2021, 44(2):107-120.
	Clinical Microbiology Group of Laboratory Medicine Branch of Chinese Medical Association, Clinical Microbiology Group of Microbiology and Immunology Branch of Chinese Medical Association, Clinical Microbiology and Infection Branch of China Association for the Promotion of International Exchange of Medical Care. Chinese expert consensus on metagenomics next-generation sequencing application on pathogen detection of infectious diseases[J]. Chin J Lab Med, 2021, 44(2):107-120.
[8]	刘可君, 郭世富, 崔乐, 等. 基因测序技术在临床检验领域的应用及国内外监管现状比较研究[J]. 中国药事, 2018, 32(11):1520-1530.
	Liu KJ, Guo SF, Cui L, et al. Application of Gene Sequencing Technology in the Field of Clinical Testing and Comparative Study on Current Situation of Domestic and Ineternational Supervision[J]. Chin Pharm Aff, 2018, 32(11):1520-1530.
[9]	《中华传染病杂志》编辑委员会. 中国宏基因组学第二代测序技术检测感染病原体的临床应用专家共识[J]. 中华传染病杂志, 2020, 38(11):681-689.
	Editorial Committee of Chinese Journal of Infectious Di-seases. Clinical practice expert consensus for the applica-tion of metagenomic next generation sequencing[J]. Chin J Infect Dis, 2020, 38(11):681-689.

[1]	石峰, 郭竹英, 郭海艳.新型冠状病毒肺炎患者外周血淋巴细胞亚群变化的临床意义[J]. 诊断学理论与实践, 2022, 21(05): 619-624.
[2]	包志瑶, 孟文凯, 沈继敏, 李庆云.成人继发于化脓性扁桃体炎的血行播散性肺炎1例报道并文献复习[J]. 诊断学理论与实践, 2022, 21(04): 520-523.
[3]	新冠病毒定点医院公共学科工作模式撰写组.开云网页登录医学院附属瑞金医院抗击新型冠状病毒定点医院公共学科工作模式[J]. 诊断学理论与实践, 2022, 21(02): 118-127.
[4]	中华医学会内分泌学分会.新型冠状病毒肺炎疫情下骨质疏松症管理专家建议[J]. 诊断学理论与实践, 2022, 21(02): 133-135.
[5]	中华医学会内分泌学分会.新型冠状病毒肺炎疫情下肾上腺疾病管理专家建议[J]. 诊断学理论与实践, 2022, 21(02): 139-142.
[6]	陈长强, 孟俊, 金佩佩, 戴菁.定点医院新型冠状病毒肺炎患者核酸检测工作的实践和探索[J]. 诊断学理论与实践, 2022, 21(02): 143-149.
[7]	施莺莺, 钟旭, 刘嘉琳, 何乐, 熊少洁, 翁懿, 丁成唯, 杨溢, 陈伟红, 邱力萍, 辛海光.新型冠状病毒疫情相关防疫工作人员感染防控实践调查分析及对策[J]. 诊断学理论与实践, 2022, 21(02): 178-183.
[8]	蒋琰, 林薇, 黄晨, 景峰.疫情下急诊科应急物资管理模式的探索与实践[J]. 诊断学理论与实践, 2022, 21(02): 212-215.
[9]	于平, 裘卫宇, 王旭, 张徐婧, 尚寒冰, 顾志冬, 林靖生, 景峰, 杨之涛, 毕宇芳, 陈尔真.大型方舱医院药品保障管理的实践与探索[J]. 诊断学理论与实践, 2022, 21(02): 221-224.
[10]	万瑾, 林婧, 丁芸, 陆琳, 成杰.特大型城市综合性医院疫情防控期间涉医电话咨询应对模式与实践[J]. 诊断学理论与实践, 2022, 21(02): 225-228.
[11]	查庆华, 王晓宁, 张寅, 倪雪萍, 陈燕, 朱唯一.新型冠状病毒流行期间医院外核酸采样工作的探索与实践[J]. 诊断学理论与实践, 2022, 21(02): 229-233.
[12]	庄蕾, 高卫益.新型冠状病毒肺炎疫情期间非定点医疗机构“分区管理”策略[J]. 诊断学理论与实践, 2022, 21(02): 245-247.
[13]	虞佩, 金瑞, 唐静, 陈海涛, 高卫益.新型冠状病毒感染疫情期间非定点医疗机构急诊区域的管理策略[J]. 诊断学理论与实践, 2022, 21(02): 248-251.
[14]	徐雯莉, 丰青, 赵任, 奚菁, 李莉, 王伟, 王晋申, 杨晖, 严明琦, 陈沁, 陈芸.上海新型冠状病毒感染定点医院整建制转化方案的构建与实践经验总结[J]. 诊断学理论与实践, 2022, 21(02): 257-260.
[15]	陈沁, 徐雯莉, 丰青, 陈瑜, 邓雪芹, 陈芸, 庞碧芸.新型冠状病毒肺炎收治定点医院护理人力资源的调配与实践[J]. 诊断学理论与实践, 2022, 21(02): 273-276.