肿瘤生物信息学课题组
段斌,开云网页登录
系统生物医学研究院PI,长聘教轨助理教授。其课题组专注于肿瘤计算系统生物学,聚焦机器学习、生物信息学与肿瘤医学的交叉研究,旨在解析肿瘤微环境(包括免疫和微生物微环境)中基因型、分子表型与临床表型的深层关联。
近五年,课题组长段斌博士以第一或通讯作者(含共同)在《Science Advances》《Nature Communications》《Genome Biology》等国际知名期刊发表论文7篇,开发了多项具有国际影响力的计算工具,包括MUSIC(2019,Nature Communications)、scLearn(2020,Science Advances)和SpaDo(2024,Genome Biology),其中MUSIC与scLearn分别入选当年“中国生物信息学十大进展”。
段斌博士主持多项国家及地方科研项目,获国家自然科学基金青年项目资助,入选“上海市青年科技英才扬帆计划”“上海市超级博士后”等人才计划,担任《Nature Methods》《Genome Biology》等国际期刊审稿人,同时为上海市生物信息学会会员。
课题组长:段斌
邮箱:binduan@sjtu.edu.cn
课题组成员
工作人员:
主要研究方向
肿瘤关键分子表型的刻画与预测;
肿瘤微环境(包括免疫微环境与微生物微环境)的解析;
基因型、分子表型与临床表型之间关联的推断;
其他肿瘤相关方向(支持组员结合兴趣与专业背景自主探索)。
课题组网站
https://binduanlab.org.cn/